Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcniQ9Z2V9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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