Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Robo3Q9Z2I4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Robo3Q9Z2I4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms