Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn7Q9Z261 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn7Q9Z261 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cldn7Q9Z261 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn7Q9Z261 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cldn7Q9Z261 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cldn7Q9Z261 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn7Q9Z261 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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