Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh3bp5Q9Z131 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms