Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn3Q9Z0G9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.6 ms