Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx1Q9WV80 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms