Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vav3Q9R0C8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms