Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Col4a4Q9QZR9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms