Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ercc4Q9QZD4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc4Q9QZD4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms