Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnnt3Q9QZ47 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms