Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phtf1Q9QZ09 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf1Q9QZ09 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms