Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PnckQ9QYK9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PnckQ9QYK9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms