Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Kcnip3Q9QXT8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms