Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnpy2Q9QXT0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnpy2Q9QXT0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnpy2Q9QXT0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnpy2Q9QXT0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnpy2Q9QXT0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms