Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmQ9QXG2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms