Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms