Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SrfQ9JM73 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms