Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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