Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Higd1aQ9JLR9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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