Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Col5a3Q9JLI2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col5a3Q9JLI2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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