Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlr5Q9JLF7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr5Q9JLF7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms