Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx5Q9JL61 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx5Q9JL61 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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