Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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