Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nova1Q9JKN6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nova1Q9JKN6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Nova1Q9JKN6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nova1Q9JKN6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Nova1Q9JKN6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nova1Q9JKN6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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