Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnga3Q9JJZ8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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