Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms