Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn12Q9ET43 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn12Q9ET43 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms