Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf6Q9DBU5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf6Q9DBU5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms