Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Riok3Q9DBU3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok3Q9DBU3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms