Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fundc1Q9DB70 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms