Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
H2al1mQ9DAD9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms