Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smco2Q9DA21 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms