Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms