Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D8L0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D8L0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms