Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn9Q9D805 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn9Q9D805 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms