Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl40Q9D783 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms