Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms