Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PudpQ9D5U5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PudpQ9D5U5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms