Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms