Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrameQ9D4Z5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms