Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms