Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lonrf3Q9D4H7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms