Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Snx29Q9D3S3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx29Q9D3S3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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