Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms