Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx20Q9D2Y5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx20Q9D2Y5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms