Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9D2Q3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms