Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ToporslQ9D2F8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms