Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D1F3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms