Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl28Q9D1B9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl28Q9D1B9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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