Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syf2Q9D198 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms